揭示近江牡蛎种质资源格局形成机制
近江牡蛎 王威摄
本报讯（记者廖洋 通讯员王敏）中科院海洋研究所贝类遗传与进化研发团队在牡蛎环境适应演化机制研究中取得新进展，揭示了气候变化对牡蛎种质资源格局形成的影响以及可塑性在其环境适应中的重要作用。11月12日，相关论文在线发表于《通讯—生物学》。
全球气候变化对海洋生物多样性及生态系统稳定性造成严重威胁。除了全球温度升高，不同沿海河口区的盐度差异亦会因为地表径流输入差异逐渐增大。这些环境变化的影响因物种而异，而基石物种的种群改变将会对生态系统的稳定性造成重要影响。解析基石生物如何适应环境变化，对评估气候变化对河口生态系统的影响具有重要的现实意义。
近江牡蛎是河口区生态系统中重要的基石性物种，作为滤食性贝类可提供多种生态系统服务功能，广泛分布于西北太平洋沿海各河口区。因其体形大、生长快速，历史上其广泛分布于我国各大河口，是重要的生计渔业。
记者了解到，近年来，因过度捕捞、栖息地破坏、陆源污染以及径流量降低等原因，近江牡蛎野生资源量锐减，特别是在我国北方地区出现零星分布的局面，甚至在部分区域呈功能性灭绝状态。因此，急需对近江牡蛎开展资源修复以及人工改良增殖。然而，现阶段关于近江牡蛎地理分布格局的形成及其对温度和盐度的适应机制研究仍然缺乏。
此次研究获得了近江牡蛎染色体水平的高质量基因组（613.89Mb），contig N50为6.97Mb，是目前已知的海洋软体动物中连续性最好的基因组。
此外，该研究解析了我国各大河口区近江牡蛎的遗传结构，将其大体分为3个地理群体，即北部渤黄海群体、中部长江口附近群体以及南部福建以南海域群体。这一群体结构的形成与我国南北中河口区的温盐梯度、我国沿岸的海流流向、历史上的地质事件以及近百万年来的冰期/间冰期的周期性变化规律有关。
团队利用选择性清除分析技术，鉴定出51个具有受选择信号的候选基因——多数是响应盐度和温度变化的。响应环境变化的高可塑性基因的上游非编码调控区表现出更强的遗传分化，这与近江牡蛎近缘种长牡蛎与福建牡蛎姊妹亚种间的适应分化机制一致。
该研究揭示了近江牡蛎种质资源格局的形成机制，挖掘了环境适应性的优异基因集，研究结果可为遗传保护单元的划分、种质资源的评估以及优异种质的利用提供理论基础。基于该研究成果，团队正在开展近江牡蛎遗传改良以及修复性养殖与牡蛎礁建设等工作。
相关论文信息：
https://doi.org/10.1038/s42003-021-02823-6