肝内胆管癌分子特征全景图谱绘就

本报讯 近日,中国科学院院士、复旦大学(附属中山医院)肝癌研究所樊嘉团队与中国科学院上海药物研究所研究员周虎、中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员高大明等团队合作,在一项最新研究中全面解析了肝内胆管癌的分子特征全景,为肝内胆管癌的临床诊治提供了新思路和新策略。研究成果在线发表于《癌细胞》。

研究人员利用262例在中山医院肝外科手术切除的肝内胆管癌患者来源的样本,综合基因组、转录组、蛋白质组、磷酸化蛋白质组和微生物组等多组学多维度数据,首次系统性绘制了肝内胆管癌的多维分子图谱,为肝内胆管癌的发生发展机制、精准分子分型、预后判断和个性化治疗策略提供了新思路。

研究人员建立了以蛋白质组为核心肝内胆管癌患者的分子分型:炎症型、间质型、代谢型和分化型,4个亚型在基因组、免疫微环境、治疗策略、临床预后等方面具有独特的特征,有望指导临床的个体化诊治;并明确了肝内胆管癌5个主要驱动基因(TP53、KRAS、FGFR2、IDH1/2、BAP1)的针对性的潜在治疗靶点,深度揭示了这些突变与细胞周期、药物代谢、炎症—感染等生物学过程的关联性。

同时,研究人员揭示了黄曲霉毒素及中草药马兜铃酸所造成的基因突变指纹在肝内胆管癌发生发展中的重要作用,为病因预防提供了线索。研究发现,中国人群样本中特异性存在黄曲霉毒素突变指纹,与高肿瘤突变负荷和高NK细胞浸润等显著相关。FGFR2的融合和突变可能通过激活Rho GTPase通路来促进iCCA发展,其部分融合蛋白衍生肽具有较强免疫原性,是潜在免疫抗原靶点。

樊嘉表示,这项研究通过整合多组学数据,较为完整地揭示了肝内胆管癌的分子特征及发生发展机制,是临床科学与蛋白组等基础科学的强强联合,在重大疾病的诊断标志物以及治疗性靶标上取得突破性进展。这些成果将进一步扩大我国在精准医学领域的优势,推动生物医药产业创新性发展,为探索肿瘤异质性和实现个体化治疗作出重要贡献。(黄辛)

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https://doi.org/10.1016/j.ccell.2021.12.006