数字“珍奇柜”展品不一般

一项雄心勃勃的倡议,俗称“扫描所有脊椎动物”计划,如今已准备就绪。3月6日,研究人员在《生物科学》上宣布,该计划已完成创建一个免费在线自然历史标本库的工作,这些标本来自美国各地博物馆和大学的收藏。

该计划简称oVert,由美国佛罗里达自然历史博物馆的生物学家指导,并得到美国国家科学基金会提供的250万美元资助,涵盖了两栖动物、爬行动物、鱼类和哺乳动物一半以上的属。

2017年至2023年间,18个机构的研究人员使用CT扫描,对超过1.3万个脊椎动物标本进行了三维重建。虽然大多数模型都是骨骼,但其中一些模型用临时增强对比度的溶液进行了染色,使研究人员能够看到皮肤、肌肉和其他软组织。

当扫描特别大或笨重的标本时,比如美国爱达荷自然历史博物馆的座头鲸,oVert项目成员必须使用创造性的解决办法。

由此产生的数字动物园有点像16世纪流行的“珍奇柜”,里面经常有不寻常的动物标本。而当时这些标本通常被收藏起来仅供少数富人享用,如今公开的oVert数据对科学家、学生、教师乃至任何能上网的人都是免费的。

oVert团队报告称,截至2023年12月,该数据库的浏览量超过100万次,下载量近10万次。其收集的数据已产生了一些有趣的科学发现,包括非洲刺鼠不寻常的骨骼,以及青蛙在进化中失去和重获牙齿超过20次的证据。项目组织者还培训中学教师将这些图像用于科学教育。

展望未来,oVert团队计划继续对博物馆标本进行成像,并向公众开放。佛罗里达自然历史博物馆从事博士后研究的Jaimi Gray目前正在进行一个名为“非临床断层扫描用户研究网络”的项目,旨在与科学、工业和教育领域的广泛用户网络共享oVert数据。

“我们并不是第一个点燃标本三维成像火焰的人。”项目负责人、佛罗里达自然历史博物馆爬虫学馆长David Blackburn说,“但我们帮助培育和发展了它,使其得到传播并‘点燃’了许多博物馆和科学家的热情。”(李木子)

相关论文信息:

https://doi.org/10.1093/biosci/biad120