本报讯 近日，中国水产科学研究院南海水产研究所遗传育种创新团队对黄鳍棘鲷基因组解析的研究取得进展。相关研究成果在《基因组学》上在线发表。
黄鳍棘鲷是华南咸淡水区域主要养殖的鱼类之一，但长期以来，黄鳍棘鲷野生苗种生长相对缓慢，亟待开展黄鳍棘鲷生长快、抗病能力强的新品种选育。绘制黄鳍棘鲷基因组精细图谱，可为其重要经济性状的遗传解析和全基因组选择育种提供基础数据。
团队利用第二、三代测序和Hi-C染色体构象捕获技术，构建了黄鳍棘鲷染色体水平的基因组图谱，其基因组大小为806Mb，contig N50和scaffold N50分别达到2.60 Mb和30.2 Mb，并成功将90.8%的组装序列挂载到24条染色体上，鉴定出19631蛋白编码基因，基因家族分析显示ARRDC3 和 GSTA基因家族在广盐性的鲷科鱼类中出现了大量扩张，为后续研究鲷科鱼类渗透压调节机制提供了重要参考。（张晴丹）
相关论文信息：https://doi.org/10.1016/j.ygeno.2021.04.017