拟南芥泛基因组揭示全球物种保守基因组结构

德国马克斯·普朗克植物育种研究所Raphael Mercier等研究人员发现,69个拟南芥品种的泛基因组可揭示全球物种范围内的保守基因组结构。相关论文近日在线发表于《自然-遗传学》。

研究人员展示了来自全球物种范围的69个品种基因组的染色体级基因组组装。他们发现,即使在地理位置和遗传上相距甚远的品种之间,基因组的共线性也一致。在染色体臂上,兆碱基规模的重排非常罕见,通常只出现在一个品种中。这表明核型是准固定的,染色体臂上的重排是反选择的。中心粒区域显示出较高的结构动态性,核心中心粒的差异占基因组大小变化的大部分。

泛基因组分析发现了32986个不同的基因家族,其中60%存在于所有品种中、40%似乎是可有可无的,包括18%只存在于单一品种中,这表明基因多样性尚未被开发。这69个新的拟南芥基因组组装将为未来的遗传研究提供有力支持。

相关论文信息:

https://doi.org/10.1038/s41588-024-01715-9