邻近依赖性RNA标记的生物正交掩膜酰化剂

近日,美国芝加哥大学团队报道了一种邻近依赖性RNA标记的生物正交掩膜酰化剂。相关研究成果发表于《自然-化学》。

RNA定位是高度调控的,随着亚细胞组织驱动依赖于环境的细胞生理学。尽管使用高反应性自由基或卡宾的基于接近度的标记技术,为细胞内蛋白质组织的无偏定位提供了一种强大的方法,但无偏RNA定位的方法很少,而且相对来说不那么稳健。

研究人员开发了α-烷氧基硫醇和氯烯醇酯,它们在受控的酯揭掩膜时起到强效酰化剂的作用。研究人员将这些探针与生物正交酯酶的亚细胞定位表达配对,以建立RNA空间分析的平台,用于邻近标记和测序的生物正交酰化剂(BAP-seq)。

研究证明,通过在感兴趣的区域选择性地揭开烯醇探针的面纱,可以绘制RNA在膜结合和无膜细胞器中的分布图。控释酰化剂化学和相应的BAP-seq方法扩大了接近标记技术的范围,并提供了一种强大的方法来访问RNA的细胞组织。

相关论文信息:

https://doi.org/ 10.1038/s41557-024-01493-1